天津商业大学是原国家商业部创办的高校之一。所以该中心伴随着1983年第一个开办的专业为“食品工程专业”，也是当时天津商学院成立比较早的系部之一；1985年又成立发酵工程专业。基于专业建设的需要于1985年，初期建设为生物化学实验室和微生物学实验室。到1993年9月经天津商学院批准正式成立专业基础实验室，实验室主要为各专业开设专业基础实验，包括生物化学实验、微生物实验、食品工程原理实验等。

自1998年发酵工程硕士点和2003年生物技术本科专业的建设，为了更好地服务于本专业和相关专业，学校对原有的专业基础实验室进行了整合，形成了“专业基础实验室”。该实验室除开设专业基础实验外，还为部分专业实验和研究生的“现代生物技术实验”。于2003年经天津市科委和教委评比，成为天津市第一批市级重点实验室，并连续在市级重点实验室验收评比中获得专家好评和领导的认可。在2007年，本实验中心的前身—“生物基础实验中心”获批天津市“达标实验教学中心”称号，近几年，中心建设也取得了长足的进步，在2011年学院即以本中心核心团队和学科基础为支撑，申报并获批了两个一级学科硕士点—食品科学和轻工技术与工程的硕士学位授权，同期，获批天津市“农产品加工与贮藏工程”市级重点学科，并于2013年获批天津市第二批市级实验教学示范中心建设单位。

中心自成立以来，始终坚持为学校教学科研服务的宗旨，为学校学科建设、教学科研的发展做出了一定贡献。从1996年至今，连续获得国家重点攻关、国家自然科学基金、国家863计划项目和天津市重大攻关项目、重点基金的资助，取得了一系列研究成果，在行业产生了一定影响力，并获得多项科技奖项。